Desarrollador de software bioinformático en España | CDE Almería - Centro de Documentación Europea

Descripción de la oferta

STALICLA es una empresa en fase clínica centrada en el paciente con la misión única de identificar, desarrollar y llevar la medicina de precisión a los pacientes con trastornos del neurodesarrollo (TND). En general, los trastornos del neurodesarrollo son discapacidades en el funcionamiento del cerebro que afectan al comportamiento, la memoria o la capacidad de aprendizaje de los niños, como la discapacidad intelectual, la dislexia, el trastorno por déficit de atención e hiperactividad (TDAH), los déficits de aprendizaje y el autismo. Los TNE afectan a 1 de cada 6 niños en todo el mundo.

El primer foco de desarrollo de STALICLA ha sido el Trastorno del Espectro Autista (TEA). En la actualidad, los pacientes diagnosticados con TEA representan el 1-1,5% de la población mundial. Esta enfermedad sigue siendo una necesidad médica no cubierta.

STALICLA ha reunido un equipo de clase mundial de desarrolladores de fármacos experimentados, clínicos, biólogos de sistemas computacionales, genetistas e ingenieros de software, desarrollando una plataforma de medicina de precisión, la primera en su clase, que utiliza la biología de sistemas, el aprendizaje automático y el modelado estadístico para acelerar el desarrollo de fármacos para pacientes con TNE. DEPI, la primera plataforma de descubrimiento de fármacos de su clase, caracteriza subgrupos de pacientes biológicamente similares dentro de poblaciones muy variables de pacientes con trastornos del neurodesarrollo, y además identifica tratamientos a medida. Para respaldar su plataforma de descubrimiento de fármacos y el desarrollo de su cartera de productos, STALICLA ha establecido sólidas redes en centros clínicos y de investigación de primer nivel.

La plataforma de STALICLA ya ha demostrado su eficacia a la hora de acelerar y reducir el riesgo de un primer proyecto, el STP1, adaptado a un subgrupo de pacientes con trastorno del espectro autista, que entrará en ensayos clínicos este año. Además, la unidad DDS (Discovery and Data Science) de STALICLA en Barcelona está avanzando actualmente en nuevas líneas de medicina de precisión para otros dos grupos de pacientes con TEA.

Conocimientos y programas informáticos deseados

Doctorado en Bioinformática (o en un campo relacionado) o experiencia equivalente en la industria (5+ años después de la graduación)
Linux, shell scripting, Git/Gitlab, Nextflow (o equivalente)
Python y/o R
Desarrollo y análisis de pipeline NGS (WGS y/o RNAseq)
Uso de contenedores de software (Docker y/o Singularity)
Experiencia en computación en la nube (preferentemente AWS)
Se agradece tener
Experiencia previa en la gestión de proyectos
PostgreSQL y/o MySQL
Conocimientos sobre biología molecular y genética humana
Conocimiento de ontologías y vocabularios médicos
Experiencia demostrable en diseño e implementación de ingestión de datos ETL