Bioinformático Filogenómico en Alemania

El Instituto Leibniz DSMZ-Colección Alemana de Microorganismos y Cultivos Celulares está creando un conjunto integrado de bases de datos científicas de importancia fundamental para las ciencias de la vida. Las bases de datos incluyen BRENDA, SILVA, BacDive, LPSN y TYGS, que se están desarrollando de forma muy coordinada. La plataforma de datos resultante, DSMZ Digital Diversity, proporcionará un recurso integrado y permitirá la vinculación y el análisis exhaustivo de diferentes tipos de datos científicos de todas las áreas de las ciencias de la vida. Entre las bases de datos implicadas, TYGS es una plataforma de vanguardia para la taxonomía basada en genomas procarióticos.

Funciones del puesto

El candidato deberá evaluar comparativamente e identificar las herramientas filogenómicas más avanzadas para su integración en TYGS; optimizar el rendimiento de la base de datos TYGS y de las tuberías y añadir funcionalidad; ampliar la interfaz web de TYGS para añadir nuevas funciones, mejorar la usabilidad y conectar con otras bases de datos de Diversidad Digital DSMZ; responder a las consultas de los usuarios en el servicio de asistencia de TYGS; proporcionar información a los expertos en nomenclatura del equipo LPSN; presentar resultados en talleres y establecer contactos con las comunidades de usuarios y publicar los resultados.

Criterios de selección exigidos

Los candidatos deberán poseer un doctorado, máster o diploma en bioinformática, microbiología, biología, informática o equivalente; experiencia significativa en programación en lenguajes compilados, lenguajes de scripting y bases de datos relacionales; sólida experiencia en computación de alto rendimiento y en análisis computacional de secuencias genómicas; sólidos conocimientos de arquitectura de software y control de versiones y dominio del inglés. Experiencia en programación en Java, Ruby, R, PostgreSQL o Bash; experiencia en filogenética, taxonomía o microbiología; capacidad demostrada para redactar publicaciones científicas y se valorarán los conocimientos de alemán.

Beneficios

Al candidato seleccionado se le ofrecerá un entorno de trabajo interdisciplinar con intercambio frecuente de experiencias; participación directa en la creación de una infraestructura de datos de investigación; compañeros motivados y un ambiente de trabajo agradable en un entorno científico; desarrollo y apoyo de servicios web científicos en el DSMZ; mucho espacio para la creatividad y temas desafiantes; participación en la selección del hardware personal; oportunidades de educación y formación continua y un empleador certificado según la auditoría berufundfamilie®, por lo tanto, posibilidades flexibles de conciliar la vida laboral y familiar.

Organización/Empresa – Academic Europe

Campo de investigación –

Ciencias biológicas « Otros
Informática « Otros

Perfil del investigador –

Investigador de primera etapa (R1)

País – Alemania

Plazo de solicitud – 14 de junio de 2024