El candidato a doctor trabajará en el desarrollo de modelos interpretables de aprendizaje profundo para datos multiómicos multiescala del sistema inmune con un enfoque en la investigación de enfermedades cardiometabólicas (CMD). Buscamos un candidato a doctorado altamente motivado y ambicioso para un proyecto centrado en el desarrollo de modelos interpretables de aprendizaje profundo para el análisis de datos multiómicos unicelulares y espacialmente resueltos asociados con CMD. El candidato a doctor desarrollará modelos que puedan identificar automáticamente estructuras moleculares y morfológicas clave, como grupos de células, que son esenciales para realizar predicciones informadas. El objetivo de este proyecto es potenciar el uso de datos multiómicos y espacialmente resueltos en la toma de decisiones clínicas, mejorando así la orientación terapéutica y el pronóstico.
Responsabilidades clave:
– Desarrollar modelos de aprendizaje profundo para el análisis de datos espacialmente resueltos.
– Entrenar este modelo utilizando tanto datos unicelulares disponibles públicamente en enfermedades CMD, como datos moleculares espacialmente resueltos generados por los socios de MIRACLE.
– Centrarse en la interpretabilidad del modelo para identificar regiones espaciales y perfiles inmunes significativos.
– Investigar y abordar las incertidumbres en los modelos de IA, adaptando los puntos de referencia de fiabilidad actuales para el análisis de conjuntos de datos unicelulares.
– Contribuir a las recomendaciones científicas sobre la robustez del modelo de IA.
Resultados esperados:
– Nuevos modelos interpretables de aprendizaje profundo para el análisis de datos espacialmente resueltos.
– Un nuevo clasificador de perfiles inmunes basado en IA.
Requisitos
Licenciatura (maestría o equivalente) en biología computacional, bioinformática, biología de sistemas o un campo relacionado con las STEM, como matemáticas, física, informática, etc. Además, se valorará un buen conocimiento de las Ciencias de la Salud o de la Vida, por ejemplo, Biología, Microbiología, Biología Molecular, Inmunología, Ciencias Biomédicas o Bioquímica.
Además, el candidato deberá ser capaz de trabajar tanto en equipo como de forma independiente.
– Competencias esenciales:
Dominio de técnicas de aprendizaje automático.
Sólidos conocimientos de programación, preferiblemente en Python.
Sólidos conocimientos de modelización matemática, probabilidad y estadística.
Capacidad para trabajar en colaboración en un equipo interdisciplinar.
Buena capacidad de comunicación en inglés (tanto escrita como oral).
– Se valorará positivamente:
Experiencia en biología computacional.
Familiaridad con el análisis de datos multiómicos.
Conocimiento de métodos interpretables de aprendizaje profundo.
Buenos conocimientos de inmunología y/o microbiología.
- El candidato debe poseer una licenciatura y un máster en una disciplina pertinente.
- Gran interés en seguir una carrera en investigación.
- El candidato debe ser un investigador altamente motivado, entusiasta y eficiente.
- Buena capacidad de comunicación en inglés.
Tenga en cuenta que para poder optar a este puesto los candidatos
- no deben poseer el título de doctor en la fecha de su contratación
- pueden ser de cualquier nacionalidad
- deben estar matriculados en un programa de doctorado durante el proyecto
- deben cumplir las normas de movilidad: en general, no deben haber residido o ejercido su actividad principal (trabajo, estudios, etc.) en el país de la organización contratante durante más de 12 meses en los 36 meses inmediatamente anteriores a la fecha de contratación.
El puesto de doctorado está financiado en el marco de las Acciones Marie Skłodowska-Curie (MSCA). La asignación de manutención y movilidad para el estudiante de doctorado es de aproximadamente 4.000 EUR al mes, en consonancia con los requisitos de la MSCA de la UE. Si procede, también se concederá una asignación familiar basada en la situación familiar del candidato evaluada en el momento de la contratación. Tenga en cuenta que esta cantidad está sujeta a impuestos y deducciones para las cotizaciones a la seguridad social del empleado. Todos los pagos se efectuarán en euros.
Organización/Empresa – Universidad de Berna
Campo de investigación – Ciencias biológicas » Otros
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Informática » Herramientas de modelización
Perfil investigador – Investigador de primera etapa (R1)
País – Suiza
Plazo de solicitud – 1 Sep 2025 – 22:00 (Europa/Berlín)
Más información: Euraxess
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