Título: Increase in Escherichia coli isolates carrying blaNDM-5 in the European Union/European Economic Area, 2012–2022
Resumen:Los resultados preliminares no publicados de la encuesta de Enterobacterales resistentes a carbapenemes y/o colistina (CCREsurvey) realizada en 36 países europeos en 2019 habían mostrado que NDM-5 se había convertido en la carbapenemasa más frecuentemente notificada en Escherichia coli . El objetivo de este estudio era determinar el alcance de la propagación de los aislados de E. coli portadores de bla NDM-5 en la Unión Europea/Espacio Económico Europeo (UE/EEE). El análisis de la secuenciación del genoma completo y de los datos epidemiológicos de 874 aislados de E. coli procedentes de las colecciones nacionales de 13 países confirmó el aumento de aislados de E. coli portadores de bla NDM-5 que se había detectado previamente en el estudio CCRE. Aunque el gen bla NDM-5 se detectó en 83 tipos de secuencia (ST) diferentes de E. coli procedentes de colecciones nacionales, hubo un fuerte predominio de unos pocos ST, principalmente ST167, ST405, ST410, ST361 y ST648. El elevado número y el gran tamaño de los conglomerados multinacionales en el conjunto de datos, incluidos los aislados recientes de 2022, sugieren una rápida expansión mundial en curso de estas ST de E. coli dominantes portadoras de bla NDM-5, incluida la UE/EEE. A pesar de la limitada exhaustividad de los datos, alrededor del 84,2% de los aislados de E. coli portadores de bla NDM-5 con información disponible sobre viajes y/o hospitalización en los seis meses anteriores al muestreo estaban vinculados a un país fuera de la UE/EEE, principalmente países de África y Asia.
Summary:Unpublished preliminary results of the survey of carbapenem- and/or colistin-resistant Enterobacterales (CCREsurvey) conducted in 36 European countries in 2019 had shown that NDM-5 had become the most frequently reported carbapenemase in Escherichia coli . The aim of this study was to determine the extent of the spread of E. coli isolates carrying bla NDM-5 in the European Union/European Economic Area (EU/EEA). Analysis of whole genome sequencing and epidemiological data of 874 E. coli isolates from the national collections of 13 countries confirmed the increase of E. coli isolates carrying bla NDM-5 which was previously detected in the CCRE survey. While the bla NDM-5 gene was detected in 83 different E. coli sequence types (STs) from national collections, there was a strong predominance of a few STs, mainly ST167, ST405, ST410, ST361, and ST648. The high number and the large size of multi-country clusters in the dataset, including recent isolates from 2022, suggest an ongoing rapid global expansion of these dominant E. coli STs carrying bla NDM-5, including the EU/EEA. Despite limited data completeness, about 84.2% of the E. coli isolates carrying bla NDM-5 with available information on travel and/or hospitalisation within the six months before sampling were linked to a country outside of the EU/EEA, mainly countries in Africa and Asia.
Fecha publicación: 2023
Autor: Centro Europeo para la Prevención y el Controlde las Enfermedades; Alm, Erik ; Kohlenberg, Anke ; Linkevicius, Marius ; Monnet, Dominique L ; Palm, Daniel ; Svartström, Olov
ISBN / ISSN: 978-92-9498-627-6
Link: https://n9.cl/3txdf
Palabras clave: antibiótico , ciencias médicas , enfermedad del sistema digestivo , enfermedad infecciosa , genética , informe , muestreo , resistencia a los antimicrobianos , salud pública
Keywords: antimicrobial , antimicrobial resistance , antimicrobial resistance , public health , antibiotic , report , medical sciences , infectious disease , infectious disease , genetics , sampling , medical sciences , public health , report