El Departamento de Matemáticas y Ciencias de la Computación (IMADA) de la Universidad del Sur de Dinamarca (SDU), Campus de Odense, invita a presentar solicitudes para un puesto de candidato a doctor en Ciencias de la Computación, financiado en su totalidad por un importante proyecto de investigación de la Fundación Novo Nordisk (NNF). Los candidatos seleccionados pasarán a formar parte del departamento de Ciencia de Datos y Estadística.
El candidato seleccionado trabajará en Odense, bajo la supervisión principal del profesor Ricardo J. G. B. Campello, pero también deberá trabajar en estrecha colaboración con colaboradores tanto de la SDU (incluidos los postdoctorados que se contraten en el proyecto) como del extranjero. En particular, el proyecto implica una colaboración formal con el Instituto de Genómica Computacional de la Universidad RWTH de Aquisgrán, Alemania. Se espera que se realicen visitas de investigación a nuestro socio de investigación en Aquisgrán para formación especializada.
La fecha de inicio propuesta es en abril o mayo de 2024, pero un inicio ligeramente anterior o posterior es negociable. La contratación se hará por un plazo de 3 (tres) años con un salario competitivo y seguirá el programa de estudios de doctorado en la Facultad de Ciencias.
Perfil del candidato
El candidato ideal tiene formación o experiencia en uno o varios de los temas siguientes
- Minería de datos («clustering» y detección de «outlier»)
- Machine Learning ( aprendizaje automático no supervisado y semisupervisado)
- Bioinformática (por ejemplo, análisis de datos de expresión génica)
El candidato seleccionado contribuirá a avanzar en el estado del arte de la investigación en minería de datos y aprendizaje automático con aplicaciones en biología computacional mediante:
- El desarrollo de algoritmos especializados de clustering y minería de datos visuales con un enfoque en aspectos desafiantes de conjuntos de datos de aplicaciones específicas, tales como conjuntos de datos encontrados en el campo de la biología computacional y la bioinformática.
- Desarrollo de métodos especializados para la evaluación automática o semiautomática, posiblemente asistida visualmente, y la selección de modelos de dichos algoritmos (no supervisados y semisupervisados).
- Desarrollo de soluciones a medida para integrar el conocimiento del dominio en algoritmos y métodos de evaluación agnósticos del dominio, con especial atención al análisis de datos de secuenciación de ARN unicelular (scRNA-seq).
- Llevar a cabo una amplia evaluación experimental y comparativa de algoritmos y métodos de evaluación en conjuntos de datos sintéticos y reales, con especial atención a los conjuntos de datos de ARNc-seq.
- Desarrollo de herramientas de software compatibles para su uso integrado con paquetes populares de análisis de scRNA-seq, que se pondrán a disposición para su distribución pública.
Requisitos
Imprescindible:
- Máster pertinente en informática, ciencia de datos, estadística computacional, bioinformática, ingeniería informática o campo relacionado que proporcione una formación suficiente en informática, matemáticas y estadística.
- Conocimientos avanzados de programación.
- Conocimientos avanzados de comunicación verbal y escrita (se requiere dominio del inglés).
Deseable:
- Dominio de Python.
- Experiencia en diseño de algoritmos, aprendizaje automático y análisis de datos.
- Se valorará la experiencia en el análisis de datos biológicos.
Organización
Universidad de Syddansk
Ubicación
Dinamarca
Campo de investigación
Informática
Fecha límite: 1 Feb 2024
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